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中研院大数据分析基因突变,助了解神经疾病

2024-12-27 201


中研院研究团队将生物资讯结合大数据分析,探讨 RNA 编辑机制与基因突变关系,为病理基因体学提供新的思考角度,研究有助于了解自闭症、癫痫等复杂神经疾病。

DNA 是由 4 种核苷酸 A、C、G、T 所组成,其排列顺序也蕴藏遗传的讯息,这些讯息需先转录成 RNA,再编辑转译成蛋白质,才能运作生命机制,但过去相关研究在讨论基因突变的致病性时,未曾考虑过 RNA 编辑机制的影响。

中研院今天发布新闻稿指出,中央研究院基因体研究中心研究员庄树谆团队,将生物资讯结合大数据分析,探讨“A-to-G RNA 编辑(RNA editing)机制”与基因突变的关系,为病理基因体学提供新思考角度,那就是在判断基因突变的危害性时,除了看 DNA 序列,也应考量 RNA 转录资料,才能更精确地评估。

▲ 庄树谆(中)研究团队,右二为第一作者麦德伦。(Source:中研院)

中研院指出,基因突变是指基因中的 A、C、G、T 排列发生变异,如果某个位置本应是 A,却变成 G,即是发生“A / G 点突变”,且如果突变发生在重要的基因位置,影响到后续产生的蛋白质功能,便会对生命体造成危害。

由于 A-to-G RNA 编辑机制可以在 DNA 转录成 RNA 时,将 RNA 中的 A,转换成 G,因此庄树谆大胆假设 A-to-G RNA 编辑机制,可使某些 A / G 点突变的危害性下降,并进行相关研究。

中研院指出,研究团队整合了 447 名不同人类个体的 DNA 及 RNA 序列资料,进行大数据统计与演化分析,并评估 A / G 点突变的危害程度、在群体中的发生频率及其与 A-to-G RNA 编辑机制间的关系,再深入分析“千人基因体计划”(1,000 Genomes Project)搜集到逾 2,000 人的 DNA 序列资料后证实,A-to-G RNA 编辑事件确实和 A、G 的 2 种核苷酸的发生率有关,尤其当 A / G 点突变所造成的危害越大,相关性就越大。

庄树谆表示,A-to-G RNA 编辑机制的正常与否,和自闭症、癫痫及阿兹海默症等复杂的神经疾病密切相关,此研究结果将有助于了解相关疾病,可望减少探讨基因突变时对其致病及危害程度的误判。

中研院表示,此研究已于今年 9 月发表于《基因体研究》(Genome Research)国际期刊。

(作者:吴欣纭;首图来源:pixabay)

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