要将科研成果成功商品化并进入市场，过程非常艰难，需耗时非常久的时间，也需要政府不间断的投入与补助，才有可能十年磨一剑，孵出成熟的产品。科技部“研发成果萌芽计划”自 100 年起推动，以主动探勘学术重大研发成果与早期原创技术，把台湾具原创且顶尖的前瞻研发成果，同步发展成技术与事业，最终达成商业化目标与成立新创企业。至今协助成立 45 家新创公司，吸引超过 9 亿元的资金投入。
萌芽计划在八年时间，主动探勘包括 Nature、Science 等各领域顶尖期刊，超过 1300 项技术，计划由初期 6 校设置功能中心扩展至今已有 15 校国际产学联盟，并协助成立 45 家新创公司，吸引新台币 9 亿元之民间投资。此外更培育台湾少见的技术经理，能主动发掘有潜力的顶尖研发成果，进行辅导协助找出特定应用、进行概念验证、打造原型机并完成商业计划书。迄今培养超过 40 名技术经理，协助辅导提出 353 件早期商业化规划，并辅导核定补助之 146 件萌芽个案，顺利将实验室技术成功带入市场。
科技部长陈良基表示，台湾学术单位有很多很好的研发成果，但要让这些成果进入市场非常困难，很多新科技因没有后续的投入，常常无以为继。陈良基在担任台大副校长时，就与当时的国科会合作，协助台大教授将研发成果推进到下一阶段。
另外“科学技术基本法”也于 106 年公布修正，放宽股票处分之限制，并明定研究人员兼职之资讯公开、利益回避、监督管理、查核等相关事项，行政院也在今年初修正发布《政府科学技术研究发展成果归属及运用办法》。此举让具有公职身份的研发人员，在创业上不再因利益问题而绑手绑脚，能够放开新作研发，产生更大的效益。
萌芽计划辅导之厂商炳硕生医开发出“微创骨科手术机器人辅助系统”，使外科医生可单手持握精巧袖珍机器手臂，透过导航影像提供手术导引精准穿刺病患手术部位，大幅降低脊椎手术的风险。目前资本额已经超过新台币 1 亿元，并进驻竹北生医园区。
台湾丹麦跨国新创团队柏胜生技开发便携式医疗检测仪器，仅需要一滴血，无须专业人员，在 10 分钟内就可以得到媲美实验室专业仪器精准度的检测结果，目前主要应用于病媒蚊相关之传染性疾病检测包括登革热、兹卡、日本脑炎等。2018 年 3 月获得欧盟展望 2020 第二阶段的中小企业 200 万欧元奖金，目前公司估值已达新台币 5 亿元。
台湾学术能力十分充沛，有不少前瞻研究原创性极高，科技部认为这些重大研发成果不应停留于实验室内，配合政府新创政策，鼓励研究团队不仅专注于期刊发表，更将具有商业潜力的顶尖技术，善加辅导应用于市场，造福国人。
