非转译区(untranslated regions,UTR)是一段位于 mRNA 编码序列起始端侧翼(5’UTR)和末端侧翼(3’UTR)的序列。正如它们的名字,它们虽然由 DNA 转录成 mRNA,但不会被转译成蛋白质。UTR 通常由 RNA 结合蛋白(RNA binding protein)和 micro-RNA(miRNA)等非编码 RNA 识别,与调节 mRNA 稳定性、转译和定位有关。当这些调节机制改变时,细胞及分子的讯息传递也会跟着改变,进而影响表型、导致疾病,甚至影响疾病结果。目前大多癌细胞的研究显示,当 3’UTR 缩短,会活化致癌基因(oncogene)。
然而,近日由贝勒医学院(Baylor College of Medicine)和德州大学医学分部(University of Texas Medical Branch,UTMB)研究团队发表于《Nature Genetics》研究结果颠覆了现今癌症主流的认知,3’UTR 缩短促进乳癌肿瘤生长的机制是关闭肿瘤抑制基因(tumor suppressor gene)表现,而非活化致癌基因。
RNA 之间能借由竞争结合共同的 microRNA 反应序列(microRNA response element,MRE)达到相互调节,而这种调控模式称为竞争性内源 RNA(competing-endogenous RNAs,ceRNAs)。该研究团队使用分子实验并结合计算生物学(computational biology)来分析乳癌基因体的大数据,然后发现,转录体中,呈现出惊人的的 3’UTR 缩短富集,这些 3’UTR 缩短富集会扮演 ceRNAs 角色,其中 EPS15 和 NFIA 等 9 种 3’UTR 缩短基因会与肿瘤抑制基因 PTEN 竞争,进而阻断 PTEN 基因表现。然后,该研究团队使维持 3’UTR 序列稳定的 NUDT21 基因表现减弱(knockdown),结果发现 PHF6 和 LARP1 等肿瘤抑制基因表现也受到抑制。
该研究团队 Wei Li 教授表示,过去人们总是将注意力集中于可能会导致癌症发展的基因突变,但这种方法还不足以解释所有癌症。因此他们采取了不同的方法,并且证实了 3’UTR 缩短在阻断肿瘤抑制基因表现。借由调控 3’UTR 缩短来调节 PTEN 和其他乳癌相关肿瘤抑制基因,进一步应用于乳癌治疗或乳癌基因筛检,都是未来可能会发生的事情。
- 3′ UTR shortening represses tumor-suppressor genes in trans by disrupting ceRNA crosstalk
- Research challenges current mechanism of tumor formation
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