不过，虽然技术上可行，但道德上基因编辑胚胎的技术多数国家都还不允许。在欧洲大部分地区这都是非法行为，美国也禁止。根据 2003 年中国政府发布的关于试管婴儿的指导文件，也禁止这种做法，但目前尚不清楚贺建奎是否得到特别许可或无视指导。
在哪里做的手术？目前没人承认
此外，贺建奎团队是否真正做到他们宣称的事情，以及在哪里做到的，都是媒体质疑的焦点。根据先前资讯，团队可能是在深圳的医院进行这项基因编辑手术，网络还传出这份手术的审查申请书，文件还表示：申请报告表示，“这将是超越 2010 年获得诺贝尔奖的体外受精技术领域的开创性研究，将为无数的重大遗传性疾病的治疗带来曙光”。
可是新闻出来之后，有媒体去电询问这间医院，深圳和美妇儿科医院相关负责人对记者否认有进行该试验。“这事件还在调查，但可以肯定的是孩子不是在我们医院出生的，实验也不是我们这边做的。我们对这事件还在调查，是哪个部门公布这件事。”
另外，记者也致电南方科技大学贺建奎电话，但无人接听；记者随后向贺建奎邮箱发邮件，收到自动回复，“我 11 月 26 日至 29 日在香港参加第二届国际人类基因组编辑峰会，因为网络关系，我可能无法及时回复你的消息。”
“现在贺教授不接受媒体采访，过几天统一回应。对于此例研究，更多消息不能透露，这个实验不是因为母亲有艾滋病，也不能透露婴儿是在哪个医院出生的，因为个人隐私不能说太多。”负责贺建奎媒体的负责人陈远林对媒体表示。
另外，中国的官方单位似乎也对这件事一无所知，也有媒体询问“深圳市卫生计生委医学伦理专家委员会”，该单位相关负责人表示，先前也不知情，才刚刚了解相关情况，正在查证。
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